Laut Satzung des Vereins setzt Sí El Salvador seine Projekte in Kooperation mit anerkannten und erfolgreichen gemeinnützigen Institutionen in El Salvador um. Mit ihrer Hilfe werden förderungswürdige Projekte ausgesucht, die den Vereinsmitgliedern in Deutschland vorgestellt und zur Unterstützung vorgeschlagen werden.

Die FUNDESO zeichnet sich durch eine gut funktionierende Verwaltung aus und verfügt über die notwendige Infrastruktur und Kontakte, um förderungswürdige Projekte auszusuchen, durchzuführen und nicht zuletzt die ordnungsgemäße Verwendung von Geldern zu kontrollieren. Aus diesen Gründen wurde die FUNDESO als lokale Partnerorganisation ausgewählt.

Auch wenn Sí El Salvador viele Projekte zusammen mit FUNDESO realisiert, können diese auch mit anderen gemeinnützigen Organisationen implementiert werden. Oftmals sind auch mehrere Partner an einzelnen Projekten beteiligt.